畜禽育種國家重點實驗室依托于廣東省農業(yè)科學院畜牧研究所，于2010年由科技部立項，2013年建成通過驗收。是廣東省直高校和研究所農業(yè)領域唯一的國家重點實驗室。

實驗室以豬雞重要經濟性狀遺傳的應用基礎、畜禽育種新技術、畜禽新品種（配套系）培育、遺傳與營養(yǎng)互作為主要研究內容，設立遺傳基礎研究室、雞育種研究室、豬育種研究室、育種新技術研究室、營養(yǎng)支撐技術研究室等五個專業(yè)實驗室。設立了"學術委員會"和"管理委員會"兩個指導、管理機構，實驗室現(xiàn)有固定人員57人，其中博士21人，高級職稱21人。實驗室在畜禽資源利用、遺傳育種、遺傳與營養(yǎng)互作等方面取得了一系列重大創(chuàng)新，在推動行業(yè)技術進步、提高良種覆蓋率、培育和壯大區(qū)域優(yōu)勢產業(yè)、凝聚創(chuàng)新隊伍、提升創(chuàng)新能力等方面發(fā)揮著重要作用。

建設以來，實驗室共承擔在研項目101項，其中國家級項目33項。建有國家級家禽資源保種場2個，收集和保存地方畜禽品種10個，育成畜禽專門化品系和配套系30多個。獲得國家科學技術二等獎1項、省科學技術一等獎2項、省農業(yè)技術推廣一等獎1項，擁有國家級和省部級主導品種、主推技術8項。通過新品種和新技術的推廣，帶動農戶6萬戶，增收超過12億元，創(chuàng)造社會產值200億元，為我國畜牧產業(yè)的發(fā)展、社會主義新農村建設做出了重大貢獻。